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https://repositorio.uema.br/jspui/handle/123456789/6627| Título: | Caracterização genética de populações de bacurizeiros (platonia insignis mart.) nos biomas amazônico e cerrado do Maranhão |
| Título(s) alternativo(s): | Genetic characterization of Platonia insignis Mart. populations in the Amazon and Cerrado biomes of Maranhão |
| Autor(es): | Silva, Thailson de Jesus Santos Silva |
| Orientador: | Barros, José de Ribamar Silva |
| Membro da Banca: | Araujo, José Ribamar Gusmão |
| Membro da Banca: | Santos, Gabriel Garcês |
| Data do documento: | 2023-07-24 |
| Editor: | Universidade Estadual do Maranhão |
| Resumo: | O bacurizeiro (Platonia insignis Mart.) pertence à família Clusiaceae e ao gênero Platonia, única espécie pertencente a este gênero. Considerada uma espécie frutífera e madeireira das mais populares da região Amazônica e Nordeste. Apesar de ser uma espécie de importância econômica e cultural as matas de bacuri vêm sofrendo constante destruição, implicando na perda de variabilidade genética da espécie. Deste modo o objetivo desse trabalho foi caracterizar geneticamente as populações de bacurizeiros (Platonia insignis Mart.) existentes nas cidades de São Luís, Axixá, Santa Rita, Morros e Urbano Santos no Estado do Maranhão por meio de marcadores ISSR. Foi realizado o levantamento da ocorrência de populações naturais de bacurizeiros nos municípios de estudo sendo coletada 15 amostras de tecido foliar de São Luís, 13 de Axixá, 14 de Santa Rita, 15 de Morros e 15 de Urbano Santos. De cada amostra foi coletado cerca de dez folhas. As amostras foram encaminhadas ao Laboratório de Genética e Biologia Molecular Warwick Estevam Kerr (LabWick) para processamento das etapas de extração e amplificação do DNA. O DNA foi extraído segundo o protocolo CTAB. As reações em cadeia da polimerase (PCR) foram realizadas com os primers: UBC 807, UBC 808, UBC 809, UBC 810, UBC 811, UBC 817, UBC 825, UBC 826, UBC 827, UBC 828 e UBC 834, após a análise do gel de agarose os produtos gerados pelos marcadores ISSR foram convertidos em uma matriz binominal (0/1), usada para fazer as análises de caracterização genética, entre e dentro das populações. Os dados foram processados nos softwares Arlequin 3.11, PAST 4.03, Bottleneck 1.2 e no programa Fingerprint Analysis with Missing Data 1.31 (FAMD). Todos os primers testados amplificaram, apresentando um total de locus de 149. Na AMOVA os resultados de estruturação genética mostraram maior diversidade genética dentro de populações, com 73.58% e menor diversidade entre populações com 26.41%. Para o índice Fst foi obtido o valor de 0.26411 indicando uma alta diversidade genética. A análise de coordenadas principais (PCoa) revelou interação entre todos os indivíduos estudados. O coeficiente de correlação cofenética calculado na matriz de distância foi de 0.8396. O dendrograma formou 19 grupos, o maior grupo continha 15 amostras, dessas 15 amostras foi observado apenas indivíduos de uma mesma população. O índice de diversidade genética de Nei para as populações estudadas variou de 3,426 para 2,346, média de 3,636 indicando uma alta diversidade genética. Os primers 817 e 828 não apresentaram gargalo genético para nenhuma das populações no modelo (I.A.M). No modelo (S.S.M) foi observado o processo de gargalo genético para todos os primers. As populações de bacurizeiros estudadas apresentam alta diversidade genética com base nos parâmetros avaliados. Porém é possível observar que essas populações estão apresentando o processo de gargalo genético, deste modo é necessário que essa diversidade genética remanescente seja coletada e preservada in situ e ex situ de maneira a garantir a sobrevivência dessa espécie para servir como base para estudos de manejo buscando sua domesticação. |
| Resumo: | The bacuri tree (Platonia insignis Mart.) belongs to the Clusiaceae family and to the genus Platonia, being the only species in this genus. It is one of the most popular fruit and timber species in the Amazon and Northeast regions. Despite being a species of economic and cultural importance, bacuri forests have been suffering constant destruction, resulting in the loss of genetic variability of the species. Thus, the objective of this work is to genetically characterize populations of bacuri trees (Platonia insignis Mart.) existing in the cities of São Luís, Axixá, Santa Rita, Morros and Urbano Santos in Maranhão State using ISSR markers. A survey of the occurrence of natural populations of bacuri trees was carried out in São Luís, Axixá, Santa Rita, Morros and Urbano Santos in Maranhão State, collecting 15 samples of leaf tissue from São Luís, 13 from Axixá, 14 from Santa Rita, 15 from Morros and 15 from Urbano Santos. About ten leaves were collected from each sample. Samples were sent to the Laboratory of Genetics and Molecular Biology Warwick Estevan Kerr (LabWick) for processing the DNA extraction and amplification steps. DNA was extracted according to the CTAB protocol. Polymerase Chain Reactions (PCR) were performed with the primers: UBC 807, UBC 808, UBC 809, UBC 810, UBC 811, UBC 817, UBC 825, UBC 826, UBC 827, UBC 828 and UBC 834, after (PCR) reaction the products generated by the ISSR markers were converted into a binomial matrix (0/1), used to carry out genetic characterization analysis, between and within populations. Data were processed using Arlequin 3.11, PAST 4.03, Bottleneck 1.2 and Fingerprint Analysis with Missing Data 1.31 (FAMD) software. All tested primers amplified, with a total of 149 locus. In AMOVA, the genetic structuring results showed greater genetic diversity within populations, with 73.58% and less diversity between populations, with 26.41%. For the Fst index, the value of 0.26411 was obtained, indicating high genetic diversity. Principal coordinate analysis (PCoa) revealed interaction among all studied individuals. The cophenetic correlation coefficient calculated in the distance matrix was 0.8396. The dendrogram formed 19 groups, the largest group contained 15 samples, of these 15 samples only individuals from the same population were observed. Nei's genetic diversity index for the populations studied ranged from 3.426 to 2.346, an average of 3.636 indicating a high genetic diversity. Primers 817 and 828 did not present a genetic bottleneck for any of the populations in the model (A.I.M). In the model (S.S.M) a genetic bottleneck process was observed for all primers. The bacuri populations studied show high genetic diversity based on the evaluated parameters. However, it is worth noting that these populations are undergoing a genetic bottleneck process, so it is necessary that remaining genetic diversity be collected and preserved in situ and ex situ in order to guarantee the survival of this species to serve as a basis for management studies seeking its domestication. |
| Palavras-chave: | DNA Diversidade PCR Diversity |
| Aparece nas coleções: | Curso de Bacharelado em Agronomia - CCA UEMA - Monografias |
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