Organização, conservação e informatização da micoteca "prof. Gilson Soares da Silva" da Universidade Estadual do Maranhão

Abstract

A preservação de microrganismos assegura a viabilidade, morfologia, fisiologia e genética, mantendo a cultura por longo tempo. O objetivo deste trabalho foi consolidar, ampliar e informatizar a coleção de fungos fitopatogênicos (Micoteca ―Prof. Gilson Soares da Silva‖) do Laboratório de Fitopatologia da UEMA. Para a incorporação dos isolados fúngicos fitopatogênicos na Micoteca foram realizados isolamentos de partes doentes das plantas em meio de cultura, após crescimento, os fungos foram caracterizados morfologicamente através da visualização, em microscópio óptico de suas estruturas, sendo classificados pelas chaves de identificação de fungos, seguido do cadastro e deposição na Micoteca em seis diferentes métodos dependendo das características do fungo. Foram empregados os métodos de Repique Contínuo, Conservação em Solo, Método de Castellani, Preservação em óleo Mineral, Congelamento e Liofilização. Foi realizado a caracterização molecular de 51 isolados pela técnica de PCR através da utilização dos genes ITS rDNA e identificados a espécie através da análise filogenética Máxima Verossimilhança e construção da Matriz de divergência genética ajustado ao melhor modelo de substituição nucleotidica com 1000 reptições. A Micoteca foi cadastrada junto ao Sistema de Autorização e Informação em Biodiversidade sob registro nº 5991355. Atualmente conta com um acervo de 212 isolados de fungos fitopatogênicos divididos em 32 gêneros e 45 espécies fúngicas. Foram recuperados os isolados de 15 gêneros Fusarium, Colletotrichum, Pestalotiopsis, Curvularia, Aspergillus, Penicillium, Phomopsis, Gliocladium, Chaetomium, Trichoderma, Stemphylium, Corynespora, Chalara, Beauveria, e Isaria. Houve amplificação da região de interesse do DNA de 16 gêneros de fungos fitopatogênicos. Foi possível observar que a combinação da caracterização morfológica e molecular (análise filogenética e matriz de divergência genética) identificou espécies dentro de 16 gêneros. Dentre essas espécies estão novos relatos de associação com hospedeiros, como por exemplo, Alternaria ochroleuca em tomate (Solanum lycopersicon), Chaetomium fuscum em sementes de Vinagreira (Hibiscus sabdariffa), Fusarium oxysporum em Abacaxi (Ananas comosus), Neoscytalidium dimidiatum em Abacaxi (A. comosus), Phoma multirostrata em Alface (Lactuta sativa) no Brasil e Phomopsis pseudomangiferae em roseiras (Rosa sp.). Por isso a importância em manter, estocar e preservar coleções de fungos significa assegurar um patrimônio de culturas para tomada de decisões

The preservation of microorganisms ensures the viability, morphology, physiology and genetics, maintaining the culture for a long time. The objective was to consolidate, expand and computerize the collection of plant pathogenic fungi (Micoteca "Professor Gilson Soares da Silva") of Phytopathology Laboratory of UEMA. For the incorporation of fungal pathogenic isolates in Micoteca were performed insulation diseased parts of the plants in the culture medium after growth, the fungi were characterized morphologically by viewing optical microscope their structures and classified the fungus identification keys, followed by registration and deposition Micoteca in six different methods depending on the fungus characteristics. Were employed methods Repique Continuous Conservation in Solo, Castellani method, preservation Mineral Oil, Freeze and Freeze. the molecular characterization of 51 isolates by PCR using the ITS rDNA genes and identified the species by phylogenetic analysis Maximum Likelihood and construction of genetic dissimilarity matrix adjusted to best nucleotide substitution model with 1000 reptições was conducted. The Micoteca was registered by the Authorization and Information System Biodiversity under registration number 5991355, currently has a collection of 212 isolates of pathogenic fungi divided into 32 genera and 45 fungal species. isolates were recovered from 15 genera Fusarium, Colletotrichum, Pestalotiopsis, Curvularia, Aspergillus, Penicillium, Phomopsis, Gliocladium, Chaetomium, Trichoderma, Stemphylium, Corynespora, Chalara, Beauveria, and Isaria. There was amplification of the DNA of interest to the region of 16 genera of plant pathogenic fungi. It was observed that the combination of morphological and molecular characterization (phylogenetic analysis and genetic divergence matrix) identified species in 16 genera. Among these species are new reports of an association with host, such as Alternaria ochroleuca in tomato (Solanum lycopersicon), Chaetomium fuscum in vinegar seeds (Hibiscus sabdariffa), Fusarium oxysporum in pineapple (Ananas comosus) in Brazil, Neoscytalidium dimidiatum in Pineapple (A. comosus), Phoma multirostrata in Lettuce (Lactuta sativa) in Brazil and Phomopsis pseudomangiferae of rose (Rosa sp.). Hence the importance of maintaining, storing and preserving fungi collections means ensuring equity of cultures for decision­making